呼兰，满语意为“烟囱”。1734年12月27日（清雍正十二年十二月初三日）批准建呼兰城，由齐齐哈尔、伯都讷城移拨官兵500名编为八旗驻防，设呼兰城守尉1员，管辖呼兰一带镇兵和官屯。1862年12月30日（清同治元年十一月初十日）清廷批准，设置呼兰厅。翌年，正式设置呼兰厅，厅署与城守尉同驻呼兰城。1864年（清同治三年），呼兰厅迁至巴彦苏苏（今巴彦县）。1879年8月18日（清光绪五年七月初一日），裁撤呼兰城守尉，改设呼兰副都统。旋即调理珲副都统依克唐阿为呼兰副都统。
呼兰副都统辖区范围，东至小兴安岭南段西麓，西界杜尔伯特旗，南临松花江，北到通肯河流域，包括今呼兰、兰西、绥化、海伦、拜泉、巴彦、铁力、木兰、通河、汤原等县（市）。1885年（清光绪十一年），于呼兰副都统辖区北团林子设置绥化厅。1899年（清光绪二十五年），将今海伦、青冈、拜泉一带划出，设置
通肯副都统辖区，而呼兰副都统辖区相对缩小。1905年（清光绪三十一年），绥化厅升改绥化府，呼兰厅升改呼兰府（移驻呼兰城）；添设巴彦州、木兰县、兰西县，均隶于呼兰府，并设置绥兰海兵备道（道署驻绥化府城），管辖呼兰、绥化、海伦一带地方。因此，1906年2月15日（清光绪三十二年正月二十二日），清廷批准，裁撤呼兰副都统。