嗜温菌在较高或较低温度时，均不能生长，其最低温度5℃，最高温度50℃，最适宜温度为18～45℃。一般病原菌均属嗜温菌，其最适温度基本上与人类体温相同，所以实验室内培养细菌，均采用37℃。

中温微生物(mesophiles)又称嗜温菌，可区分为室温性和体温性微生物。室温性微生物，如土壤微生物和植物病原菌，适宜生长于25~40℃。体温性微生物多为人和温血动物的病原菌，其最适生长温度与宿主体温相近。

嗜温菌不耐低温，通常在10℃以下不能生长。对大肠杆菌所做的研究表明，当温度低于10℃时，嗜温菌的蛋白质合成不能启动(一旦启动，则能完成)；许多酶对反馈抑制异常敏感，不能正常行使功能。

好氧堆肥法的原理是以好氧菌为主对废物进行氧化、吸收与分解。参与有机物降解的微生物包括两类，即嗜温菌和嗜热。废物的降解过程可以分为三个阶段：堆制初期，堆层呈中温（15〜45℃),为中温阶段。此时，嗜温菌包括细菌、放线菌、真菌活跃，利用可溶性物质如糖类、淀粉迅速繁殖，堆层温度上升。当堆层温度上升到45℃以上便进人高温阶段。 从堆肥发酵开始，约一周时间，堆层温度即可达65〜70℃或者更高。此时嗜温细菌逐渐死亡，嗜热性真菌和细菌活跃，前一阶段残留和分解过程形成的溶解性有机物继续分解，半纤维素、纤维素、蛋白质等复杂有机物开始强烈分解。70℃以上，大量微生物死亡或进入休眠状态。随着生物可利用有机物的逐步耗尽，微生物进人内源呼吸阶段，活性下降，堆层温度下降，进入降温阶段。此时嗜温菌再度占优势，使残留难降解有机物进一步分解，腐殖质不断增多且趋于稳定，堆肥进入腐熟阶段。