嘉兴大学医学院是浙北地区医学专业人才培养的重要基地。其前身是1951年创办的浙江省立嘉兴卫生技术学校，曾分别于1958年以省立嘉兴医学专科学校、1960年以嘉兴医学院、1979年以浙江医科大学嘉兴分校等举办高等医学教育，2000年组建嘉兴大学医学院，2003年实质性并入嘉兴大学。

医学院下设党政办公室、教务工作办公室、学生工作办公室、团委工作办公室、基础医学部、临床医学部、药学系、护理学系、麻醉学系和医学实验中心。学校现有1家直属附属医院，7家非直属附属医院、7家教学医院、23家实习医院、1家附属社区卫生服务中心，11家社区（全科）教学基地和1家预防医学实践教学基地，学院现有临床医学、麻醉学、护理学、药学四个本科专业。

医学实验中心成立于2005年，2019年6月获批浙江省“十三五”省级重点建设实验教学示范中心, 其中医学虚拟仿真实验教学中心于2015年12月获批“十二五”省级虚拟仿真实验教学示范中心重点建设项目。目前实验室建筑面积14626平方米，教学及科研仪器设备近7000台件，设备总值9500余万元，拥有桥式超大空间可平移清醒大型活体动物成像系统、大空间可平移易清醒活体动物微成像系统、听觉生理工作站、共聚焦显微镜、全自动流式细胞分选仪、全自动流式细胞分析仪、荧光定量PCR仪、超临界萃取仪等30万元以上大型仪器设备27台套。中心下设临床技能实验室、机能学实验室、形态学实验室、药学实验室、科研实验室和实验动物中心6个二级实验室，拥有医学电子与数字健康浙江省重点实验室、生命健康智能感知浙江省工程研究中心和医学分子生物学、肿瘤光动力靶向药物研究2个嘉兴市重点实验室。中心已成为面向学校和嘉兴地区医学及相关专业开展实践教学、科学研究及技能培训等的重要平台。

近年来，医学院按照学校“做精医学”办学思路，着力建设高水平师资队伍，学院本部现有教职员工138人，专任教师92人，高级职称教师52人，其中教授22人，具有博士学位56人，博士生导师2人，硕士生导师23人。全职引进外籍院士1人，国家级特优人才1人，省级特优人才3人，入选浙江省151人才工程6人，浙江省教坛新秀1人，浙江省中青年学科带头人3人，浙江省高校领军人才培养计划高层次拔尖人才1人，浙江省高校领军人才培养计划青年优秀人才2人，浙江省钱江人才计划1人，嘉兴市杰出人才3人、嘉兴市精英引领计划创新长期人才3人，嘉兴市精英引领计划创新青年人才3人，嘉兴市“优才支持计划”科技创新拔尖人才1人， 嘉兴大学“南湖学者”特聘教授4人，校勤慎青年学者5人，校勤慎青年骨干7人，嘉兴市优才支持计划先锋型团队1个，校级“尖锋计划”团队2个。

医学院围绕基础医学、药学、临床医学和护理学等一级学科开展研究，依托医学电子与数字健康浙江省重点实验室、生命健康智能感知浙江省工程研究中心、医学分子生物学和肿瘤光动力靶向药物研究嘉兴市重点实验室，形成了以肿瘤学、脑科学、康复医学、预防医学及生殖医学为特色的学科研究方向。拥有由欧洲科学院院士，国家长江学者，浙江省千人等领衔的9个研究团队，3个市级科技创新团队和2个校级尖峰计划团队。

医学院及各附属医院现拥有国家特色专科建设单位2个，国家临床重点专科2个，GCP国家药物临床试验中心2个，省级临床重点学科7个，省重点实验室、省工程研究中心各1个，省级临床研究中心1个，省市共建医学重点学科4 个，浙北区域专病中心3个，建有标准化SPF实验动物中心2个，市重点科技创新团队29个、市重点实验室25个，临床技能实训中心3个和AHA心血管急救培训中心2个。

近年来，医学院及各附属医院总计承担省部级及以上研究项目178项，获得科研经费1.0209亿元，获得科技奖励87项（其中省部级奖项14项），发表论文2288篇（其中一级期刊395篇，SCI收录987篇），授权发明专利32项，出版专著44部。

学院致力于培养满足社会多元化需求，具备良好专业素养、终身学习能力、国际化视野的应用型高级专门人才。毕业生就业率平均达到98%以上，升学率平均达30%以上，其中临床医学专业2021年升学率高达55.96%，还和华东理工大学，南昌大学，新疆石河子大学，延边大学，浙江工业大学、浙江中医药大学等高校联合培养研究生450余人。

学院学子参加各级各类学生竞赛，取得较好成绩，获得第七届浙江省国际“互联网”大学生创新创业大赛暨第七届中国“互联网”大学生创新创业大赛选拔赛银奖1项（并获全国竞赛铜奖）；浙江省第十三届“挑战杯”建设银行大学生创业计划竞赛铜奖；浙江省第十七届“挑战杯”大学生课外学术科技作品竞赛省级三等奖，第六届全国大学生基础医学新论坛暨实验设计大赛三等奖1项；第四届全国大学生生命科学创新创业大赛创新组一等奖；浙江省生命科学竞赛二等奖1项；浙江省大学生医学技术技能大赛二等奖4项，三等奖8项；中国大学生医学技术技能大赛临床医学专业五年制赛道华东分区赛三等奖4项；中国大学生医学技术技能大赛护理学专业赛道华东分区赛三等奖1项；浙江省大学生护理竞赛一等奖2项，二等奖2项，三等奖4项；全国大学生药苑论坛创新成果奖二等奖1项，优秀论文奖二等奖1项。

学院加强国际交流与合作，与香港、美国、英国、澳大利亚等国家、地区的医学院校和医疗机构建立合作关系，开展了美国康奈尔大学、美国健康科学西部大学、英国利物浦约翰摩尔大学、美国北伊利诺伊大学的师生科研、进修访学合作项目，以及学生赴香港医疗文化夏令营学习等项目。部分学生获得全额奖学金留学深造机会。

学院秉承“精诚仁爱”的院训精神，围绕“全程、多元、协同”的医学人文教育教学理念，利用嘉兴历史文化及嘉兴大学红船精神研究中心等丰富教育资源，开展杏林文化品牌建设和师德师风建设，搭建以“一片杏林、一个杏林讲坛、一个无语良师碑、一支杏林志愿服务队”和“医学文化节、512护士节、药学文化节”为基础的第二课堂文化育人平台，培养师生精研医道、言行诚谨、仁者爱人的人文情怀。