《四川大学学报（医学版）》创刊于1959年，是由中华人民共和国教育部主管，四川大学主办的综合性医学学术期刊，主要刊登基础医学、临床医学、口腔医学、预防医学、药学、法医学等方面的研究成果及医疗技术的创新与改进等。

1959年，《四川医学院学报》创刊。

据中国知网收录信息显示，1978年该刊由半年刊变更为季刊。

据中国知网收录信息显示，1979年该刊由季刊变更为半年刊。

据中国知网收录信息显示，1980年该刊由半年刊变更为季刊。

1986年，该刊更名为《华西医科大学学报》。

2003年，该刊更名为《四川大学学报（医学版）》。

据中国知网收录信息显示，2004年该刊由季刊变更为双月刊。

2014年11月，该刊成为国家新闻出版广电总局第一批认定学术期刊。

《四川大学学报（医学版）》主要刊登基础医学、临床医学、口腔医学、预防医学、药学、法医学等方面的研究成果及医疗技术的创新与改进等。

《四川大学学报（医学版）》主要设有论著、专题报道、技术与方法、述评、研究报告、临床医学等栏目。

据2018年6月《四川大学学报（医学版）》官网显示，《四川大学学报（医学版）》编委会共有编委65人。

编委：鲍朗、毕锋、步宏、陈槐卿、陈建平、陈俐娟、陈谦明、陈扬熙、樊均明、冯玉麟、龚启勇、侯一平 黄宁、兰亚佳、李甘地、李虹、李明远、李尚为、李涛、李晓松、李幼平、刘进、刘鸣、马骁、毛萌、莫显明、欧阳钦、齐建国、秦勇、覃扬、丘小庆、石冰、石应康、宋航、唐承薇、唐红、田卫东、万朝敏、王锋鹏、王和、王莉、魏于全、文富强、伍晓汀、肖波、解慧琪、辛洪波、严律南、杨志刚、游潮、于长谋、于海洋、张立实、张林、张思仲、张肇达、张志荣、张祖辉、章崇杰、赵霞、郑虎、郑煜、周桥、周学东、周总光

据2018年6月1日中国知网显示，《四川大学学报（医学版）》出版文献共7932篇。

据2018年6月1日万方数据知识服务平台显示，《四川大学学报（医学版）》载文量为4877。

据2018年6月1日中国知网显示，《四川大学学报（医学版）》总被下载775199次、总被引38582次；（2017版）复合影响因子为0.932、（2017版）综合影响因子为0.713。

据2018年6月1日万方数据知识服务平台显示，《四川大学学报（医学版）》被引量为24998、下载量为122373；据2015年中国期刊引证报告（扩刊版）数据显示，《四川大学学报（医学版）》影响因子为0.96，在全部统计源期刊（6735种）中排1127名、在大学学报（医药卫生）（114种）中排第28名。

据2018年6月《四川大学学报（医学版）》官网显示，《四川大学学报（医学版）》被美国《医学索引》（IM/MEDLINE）、《生物学文摘》（BA）、《化学文摘》（CA）、荷兰《医学文摘》（EM）、俄罗斯《文摘杂志》、中国科技论文与引文数据库（CSTPCD）、中国生物医学文献数据库（CBMdisc）、中文生物医学期刊数据库（CMCC） 、中国学术期刊网全文数据库（CNKI）、中国学术期刊（光盘版）、万方数据-数字化期刊群等数据库收录。

据2018年6月中国知网显示，《四川大学学报（医学版）》是北京大学《中文核心期刊要目总览》（1996年第二版、2000年版、2004年版、2008年版、2011年版、2014年版）来源期刊，被JST 日本科学技术振兴机构数据库（日）（2013）、CSCD 中国科学引文数据库（2017-2018年度）（含扩展版）等数据库收录。

1989年，获得全国高等学校自然科学学报优秀编辑质量一等奖。

1990年，获得四川省首届科学技术期刊优秀期刊一等奖。

1993年，获得四川省第二届科学技术期刊评比优秀期刊一等奖。

1995年，获得四川省十佳科技期刊奖。

1997年，在第二届全国优秀科技期刊评比中获得一等奖。

1999年，获得首届国家期刊奖提名奖。

2002年，获得第二届国家期刊奖百种重点期刊奖。

2006年，获得教育部中国高校精品科技期刊奖。

2010年，获得教育厅首届四川省高校精品科技期刊奖、第三届教育部中国高校精品科技期刊奖。

2012年，获得第四届教育部中国高校精品科技期刊奖。

2014年，获得第五届中国高校精品科技期刊奖、第二届四川省高校精品科技期刊奖、2014中国国际影响力优秀学术期刊奖。

2015年，获得RCCSE中国权威学术期刊（A+）、2015中国国际影响力优秀学术期刊。

2016年，获得第三届四川省高校精品科技期刊奖。

2017年，获得2016年度中国高校百佳科技期刊、2016中国国际影响力优秀学术期刊。

据2018年6月万方数据知识服务平台显示，《四川大学学报（医学版）》获得过全国优秀科技期刊一等奖、四川省十佳期刊，第一、二、三届四川省科技期刊优秀科技期刊一等奖。

反映四川大学的医药卫生科研成果和中国国内医学科研成果和学术水平，开展中国国内外学术交流，促进医药卫生事业的发展。