四川省食品工业协会是四川省政府直属事业单位，成立于1983年。1983年至2002年，协会会长均由省政府副省长兼任，历经管学思、刁金祥、马麟、李蒙、王金祥等副省长的亲自领导。

2002年，《四川省食品工业协会机构编制方案》经四川省人民政府批准，协会机构的性质及相关职能被明确为：四川省食品工业协会是省政府直属事业单位，受省政府委托对全省食品工业进行行业指导，履行省政府赋予的行业规划、管理、指导、服务等8项职能。人员参照公务员管理。

2011年8月23日，四川省人民政府办公厅印发《关于撤销四川省食品工业协会有关事项的通知》（川办函[2011]183号），经省委、省政府同意，决定撤销省政府直属事业单位四川省食品工业协会，将原由其承担的食品工业行业管理、食品市场流通管理、食品标准质量管理等方面职责分别划入四川省经济和信息化委员会、四川省商务厅、四川省质量技术监督局；原四川省食品工业协会所属事业单位四川省酿酒研究所交由四川省经济和信息化委管理。