国大药房有限公司成立于2004年，注册资金6亿元，作为国药控股有限公司下属全部零售企业的总部，担下属全国医药零售企业的管理职责。

“十一、五”期间，公司将继续以连锁药店为核心业务，依托国药控股的品牌及资本优势开拓前进，以“家庭健康顾问”作为公司定位，全面生动地体现“关爱生命，呵护健康”理念，通过固化和复制“差异化、高起点”的赢利模式，满足中高端消费群体用药和健康的需求，建成拥有2000家药店、30亿销售规模的具有“成本领先，品种齐全，服务优良，价值提升”等优势的全国性零售终端网络，全面打造中国药品零售第一品牌。2012年公司实现零售总额47.6亿，列国内药品连锁企业百强榜首位。截至2013年6月，公司在北京、上海、天津、辽宁、江苏、安徽、浙江、山东、福建、广东、广西、宁夏、新疆、河南、山西、内蒙古等国内18个省市自治区投资组建25家子公司，覆盖全国60余个大中城市，拥有逾2000家零售药店。

1998年 第一家国大药房北京翠微店成立2001年7月20日 上海国大张杨店开张开业

2004年9月23日 国药控股国大药房有限公司正式成立

2005年 整合上海国大药房连锁有限公司

2006年 收购天津国大药房连锁有限公司

2006年 国大药房进行全国标识的统一

2006年 收购江苏大德生药房连锁有限公司

2006年 进入全国连锁药店百强榜前十名

2007年 收购北京国大药房连锁有限公司2008年 收购浙江英特药房连锁有限公司

2008年 收购沈阳天益堂药房连锁有限公司

2008年 整合宁夏医药集团成立了宁夏国大药房连锁有限公司

2011年 收购平顶山市普生药业有限公司

2024年9月，国药一致公布2024年半年报，显示公司营收、净利润同比分别下降1.57%、10.45%。其中，国大药房出现亏损，实现营业收入112.02亿元，同比下降9.30%；实现净利润-0.14亿元，同比下降104.81%，实现归母净利润-0.17亿元，同比下降107.50%。