国家水生动物病原库是一九九八年十一月由农业部批准在上海海洋大学建设的水生动物病原及相应的细胞株（系）保藏中心，是我国水产行业第一家培养物保藏机构，保藏对象包括与水产行业相关的微生物、细胞株、质粒等培养物。

于2012年10月通过农业部验收。2016年7月取得中国计量认证证书，具有病原及药残两个领域的检测资格。“病原库”充分遵循“整合、保护、共享、利用”的建设原则，建立了病原资源分类描述等技术标准和规范，系统地整合各类渔业动植物病原资源，实现了资源的数字化和网络化管理，初步建立了培养物交流和共享体系。上海海洋大学“病原库”资源体系由实物层、数据层和应用网络层三个部分组成，保藏对象包括细菌、细胞、病毒等在内的各类培养物1500余株（系），对外共享服务约500株次/年。“病原库”的建设和运转填补了我国水产专业培养物保藏的空白，成为构建我国水产动物疾病控制体系和保障水产品质量安全的重要基础平台。

“病原库”对外服务的业务范围包括：微生物的分离、鉴定、保藏；细胞株系的建立、保藏；疫苗、诊断试剂、微生态制剂等相关产品的开发等。病原库建立细胞收集的方式主要有三种：自行建立、别的单位无偿赠送和交换。通过这些方式病原库现收集保存有细胞18株，其中包括CE（草鱼囊胚细胞）、CGB（鲫鱼囊胚细胞系）、 CIK(2株，草鱼肾细胞系)、 CO（草鱼性腺细胞系）、EPC（3株，鲤鱼上皮瘤细胞）、 FHM(2株)、Hela（人子宫瘤细胞系）、 TEL（大菱鲆肌肉细胞系）、 PCK（大黄鱼肾细胞系）、 PCP（大黄鱼吻端细胞系）、 PSF（草鱼吻端成纤维细胞系）、 VERO（非洲绿猴肾细胞系）、SPHK（花鲈头肾细胞）、 SBES1（真鲷胚胎细胞）等。可提供和交换的病毒分别为细菌病毒80余株、昆虫病毒40余株、动物和人类医学病毒近100株、植物病毒40余株，但尚无水产动植物病毒提供。