国家自然科学基金委员会管理学部是国家自然科学基金委员会的学术性管理机构。

国家自然科学基金委员会管理学部负责组织拟订管理科学领域的发展战略、优先资助领域和《项目指南》，负责受理、评审和管理各类管理科学基金项目，负责国际合作交流项目的组织与管理，负责专家评审系统的组织与建设，承担重要科学问题的咨询，承办自然科学基金委交办的其他事项。