1937年8月21日,在山西大同成立挺进军司令部兼办东北四省招抚事宜。
马占山为司令,指挥骑兵第6师、新编骑兵第3师、暂编骑兵第1旅。9月,该部转进绥远。
1940年6月,新编骑兵第3师改隶暂编第3军。1941年9月,暂编骑兵第1、暂编骑兵第2旅及独立第1、独立第2团及骑兵第5团合编为新编骑兵第6师,该军改辖新编骑兵第5、新编骑兵第6师,隶属第8战区副司令长官(傅作义)部指挥。抗战期间,该军长期担任陕西北部黄河河防和伊克昭盟守备。
1945年6月,改隶第12战区。参加绥包战役(1945年10月18日至12月7日)。后参加大同、集宁作战(1946年8月3日至9月20日)中的大同防守。9月3日,进抵凉城。9月9日,进抵怀安县柴沟堡。