世界反兴奋剂机构（WADA）于1999年11月10日在瑞士洛桑成立，是国际奥林匹克委员会下设的一个独立部门。总部位于加拿大蒙特利尔。

1999年11月10日，世界反兴奋剂机构在瑞士洛桑成立。

2000年1月，世界反兴奋剂机构在洛桑举行了首次正式会议 。

2000年1月13日，举行了首次基金会会议。

2000年2月18日，中国成为世界反兴奋剂机构理事国。

2000年3月22日，举行了首届基金会全体会议。

2015年，WADA在首次全球反兴奋剂大会后开始着手制定《反兴奋剂教育国际标准》。

2018年10月24日，第二届全球反兴奋剂教育大会在北京怀柔召开。

2019年11月7日，世界反兴奋剂大会在波兰卡托维兹举行。。

2022年11月18日，世界反兴奋剂机构理事会大会投票决定杨扬和班卡连任副主席和主席。两人的第二个三年任期为2023年至2025年。

世界反兴奋剂机构的主要任务是负责审定和调整违禁药物的名单，确定药检实验室，以及从事反兴奋剂的研究、教育和预防工作。

主席：维托尔德·班卡

副主席：杨扬

世界反兴奋剂机构理事会由10至35名成员组成，理事会成员任期为3年，可连任两次。

截止至2012年7月19日之前全世界范围内所进行的71 649个兴奋剂测试中，已有107名运动员被发现违禁并受到严惩。

2016年世界反兴奋剂机构（WADA）公布了更多田径界兴奋剂丑闻的调查结果，指国际田联前主席、现任国际奥委会委员迪亚克（Lamine Diack）涉及有组织合谋及贪污，包括在2020年奥运主办城市选举中，涉嫌接受日方贿赂而投票给东京。国际奥委会已向WADA索取报告，调查是否确有其事。

2016年4月22日，世界反兴奋剂机构暂停北京兴奋剂检测实验室的资格。

2016年8月15日，世界反兴奋剂机构（WADA）致函北京兴奋剂检测实验室，认可其已完成技术整改并达到评审要求，决定立即恢复实验室认证资格。

2019年11月7日，在波兰卡托维兹举行的世界反兴奋剂大会上，世界反兴奋剂机构（WADA）基金会董事会审议并通过了新修订版的《世界反兴奋剂条例》，新条例结合了体育、社会、医学和科技领域近年来的发展变化做出修订，并将从2021年1月1日起正式生效。

此外，WADA执委会审议并通过了七项修订和新增的国际标准，包括签约方合规国际标准、实验室国际标准、禁药清单国际标准、隐私与个人信息保护的国际标准、检测和调查国际标准、治疗用药豁免国际标准以及新增加的教育国际标准和检测结果管理国际标准。其中，除了检测和调查国际标准将于2020年3月1日生效之外，其余六项国际标准将于2021年1月1日生效。

2019年11月25日，世界反兴奋剂机构称，由于在检查中发现“莫斯科反兴奋剂实验室的数据‘既不完整、也不完全可靠’”，因此提议在国际重大赛事上对俄罗斯禁赛4年。2019年12月，世界反兴奋剂机构执委会一致通过了合规审查委员会有关认定俄反兴奋剂机构不合规的建议，禁止俄罗斯在未来4年参加大型国际赛事，包括奥运会和世锦赛。

2018年9月4日，孙杨在杭州接受了一次赛外兴奋剂检查，由于对检查人员出示的资质证明存疑，此次检查最终未完成。

2019年1月，国际泳联裁决此次检查无效，孙杨不存在违反《世界反兴奋剂条例》的行为。两个月后，WADA因不满裁决结果，向国际体育仲裁法庭提出上诉。

2020年2月28日17时，国际体育仲裁法庭公布了“世界反兴奋剂机构诉孙杨和国际泳联案听证会”的裁决书，孙杨被禁赛八年，当日起生效。

2020年12月，世界反兴奋剂机构（WADA）对“瑞士最高法庭已撤销八年禁赛裁决”一事发表声明，称已得知瑞士联邦法院支持孙杨对CAS判决的改判请求，会积极采取行动，在案件回到国际体育仲裁法庭后，继续陈述其立场。

当地时间2024年8月7日晚，总部位于加拿大蒙特利尔的世界反兴奋剂机构（WADA）发表声明，就当天早些时候的一篇报道做出回应，这篇报道揭露了美国反兴奋剂机构（USADA）多年来允许服用兴奋剂的运动员参赛，至少有一起案例从未公布或没有制裁反兴奋剂规则违规行为，这直接违反了《世界反兴奋剂规则》和美国反兴奋剂机构自己的规则。

2024年11月25日，美国《纽约时报》网站引述两名知情人士的说法报道称，美国政府以某些案件处理不当为由暂停向世界反兴奋剂机构缴纳年费。世界反兴奋剂机构否认对相关案件处理不当，并认为美国此举是“出于政治动机”。