国际合作发展基金会，是“台独”顽固分子关联机构。

打着“民主”和“合作发展”的幌子，在国际上大肆从事“台独”分裂活动，极力拉拢贴靠外部反华势力，攻击抹黑大陆，以金钱等为诱饵拓展台所谓“国际空间”，企图破坏国际社会一个中国格局。

2022年8月，中国大陆方面决定对该基金会采取惩戒措施，禁止其与大陆组织、企业、个人合作，依法惩治为上述基金会提供资助或服务的组织、企业、个人，以及采取其他必要措施。禁止大陆组织、企业、个人与为上述基金会捐款的宣德能源、凌网科技、天亮医疗、天眼卫星科技等企业进行任何交易、合作，禁止有关企业负责人入境。

2022年8月，中共中央台办决定对吴钊燮担任董事长的“国际合作发展基金会”的秘书长实施制裁，禁止其进入大陆和香港、澳门特别行政区。

2024年1月，国际合作发展基金会技术团成员在销毁文件的同时也一起把瑙鲁的国旗烧毁，被瑙鲁人录像并报警，焚烧国旗者已支付保释金。