主要由土壤
微生物(异养呼吸)和根系(自养呼吸)产生．除植被冠层
光合作用，土壤呼吸作用是陆地生态系统碳收支中最大的通量．因此，精确预测陆地与大气之间碳交换需要深入理解影响土壤呼吸作用的主导因子，特别是对其主要组成部分土壤微生物和根系呼吸作用的影响机理．土壤微生物和根系呼吸作用主要是土壤中生物代谢作用的结果，因此能够影响生物活动的生态因子都会导致其呼吸强度的变化，如气候因子、土壤因子、植被及地表覆被物等．此外，人类活动引起的大气C0'浓度剧增及由此导致的增温效应，不仅是人类所面临的最严峻的全球环境问题，而且直接或间接地影响着土壤微生物和根系呼吸作用．同时，人类活动本身也会对土壤微生物和根系呼吸作用产生影响，如放牧、施肥、农药、重金属污染等