《土壤学报》前身是《中国土壤学会会志》（Bulletin of the Soil Science Society of China），创刊于1948年12月，是由中国科学院主管、中国土壤学会主办、中国科学院南京土壤研究所承办、科学出版社出版的中文（含英文摘要、关键词、图、表和参考文献）核心科技学术双月期刊。

1948年12月，《土壤学报》的前身《中国土壤学会会志》（Bulletin of the Soil Science Society of China）创刊。

1952年更名为《土壤学报》。

1955―1956年定期出版，为半年刊，科学出版社出版。

1957年起由半年刊改为季刊，全国各地邮局发行。

1966年下半年由于科研工作停顿停刊。

1978年8月经中国科学院批准正式复刊。

《土壤学报》反映土壤学各分支学科有创新或有新意的、具有较高学术价值的研究成果，主要刊登土壤科学及相关领域，如植物营养科学、肥料科学、环境科学、国土资源等领域中具有创造性的研究论文、研究简报、前沿问题评述与进展（综述与评论/新视角与前沿）、问题讨论、书评。

《土壤学报》设有研究论文、研究简报、综述与评论、信息、土壤科学与生态文明建设、土壤科学与现代农业、新视角与前沿、书评、问题讨论等栏目。

据2018年3月《土壤学报》官网显示，《土壤学报》编辑委员会有编委49人。

据2018年3月中国知网显示，《土壤学报》出版文献共4501篇。

据2018年3月《土壤学报》官网显示，《土壤学报》为中国期刊方阵期刊、全国中文核心期刊、中国科技核心期刊、中国农业核心期刊、RCCSE中国权威学术期刊、中国百种杰出学术期刊（2002―2013，2015，2016）、中国精品科技期刊（2008，2011，2014，2017）、中国最具国际影响力学术期刊（2012）、中国国际影响力优秀学术期刊（2013―2017）、期刊数字影响力百强（2015，2016）。该刊在国内享有较高声誉，为《中国科技论文与引文数据库（CSTPCD）》、《中国科学引文数据库（CSCD）》、《中国科技期刊引证报告（CJCR）》、《中国期刊全文数据库（CJFD）》、《中国学术期刊文摘（CSA）》、《中国学术期刊综合评价数据库（CAJCED）》、《中国核心期刊（遴选）数据库》、《中国科技期刊精品数据库》、中国精品科技期刊顶尖学术论文（F5000）项目来源期刊和《中国知网》（CNKI）、《中国学术期刊（光盘版）（CAJ-CD）》、《万方数据系统科技期刊群》、《中文科技期刊数据库（VIP）》的收录期刊。同时该刊在国际上也有一定影响，被美国《化学文摘》（CA）、英国CAB Abstracts系列、美国《史蒂芬斯全文数据库》（EBSCOhost）、日本《科学技术文献速报》（CBST）、日本科学技术振兴机构中国文献数据库（JST）和FAO Agris AGRINDEX等国际重要数据库和检索系统收录。

据2018年3月中国知网显示，《土壤学报》总下载1501895次、总被引145294次，（2017版）复合影响因子为3.474、（2017版）综合影响因子为2.487。

1985年荣获中国科学院首届优秀期刊奖。

1992年获中国科学院优秀期刊二等奖，同年荣获中国科协优秀期刊二等奖和国家优秀期刊二等奖。

1999年荣获江苏省优秀期刊奖。

2000年荣获中国科学院优秀期刊二等奖。

坚持四项基本原则，理论联系实际，贯彻“双百”方针，为发展国民经济服务，为科教兴国服务，为农业现代化服务，为土壤学科发展服务。