据估计，圣多里尼下面的火山在过去的20万年里喷发了12次，公元前1650年的灾难性喷发是地球在过去1万年来最大的火山爆发之一。那次火山喷发的影响可能导致位于克里特岛先进的米诺斯文明的崩溃，甚至有人说“失去的亚特兰蒂斯大陆”传说由此而来。
约公元前15世纪（柏拉图年代的900年前），席拉岛上的圣多里尼火山发生了一次大爆发，爆发导致火山口上建立的文明城市被毁灭，也引发了海啸，这次火山喷发使得原本仰赖贸易的迈诺安文明受到了重大打击，就此一蹶不振。
根据古希腊哲学家柏拉图的著作，在遥远的古代，曾经有一块大陆，在那儿有富饶的土地，孕育了具有高度文明的城帮国家，它的名字叫亚特兰提斯，也就是大西洲。突然有一天，天崩地裂，这块大陆沉入海底，从此无影无踪。
长久以来，人们一直认为有关亚特兰提斯的故事只是一个传说，并没有真正的考古依据。后来，人们在圣托里尼岛上挖掘出了阿克罗提利遗迹（Prehistoric City of Akrotiri），在那儿找到了公元前16世纪的城市遗址，这和克里特岛上出现的
米诺斯文明属同一时期，而米诺斯文明是西方文明的起源。
随着考古调查的深入，清楚地表明这座古城具有高度的文明以及富裕的生活，而它在被挖掘出来之前，是被埋在火山灰里的。再加上前面所说的火山爆发如何摧毁了圣托里尼岛的理论，学术界开始相信圣托里尼岛就是早先的亚特兰提斯大陆，公元前1500年的一次火山大爆发，把大陆的大部分刮走，沉入海底，只剩下了还在海平面上的外围岛屿。在1960年，这个论点被发布于世，并成了最为人信服的有关亚特兰提斯的学说。
观看圣托里尼岛火山口的最好的观赏处是从锡拉（Thira）、奥伊亚（OIA）、斯卡洛斯（Skaros）和阿卡罗提利（Akrotiri）。从上述五个不同的方位通过不同的角度来观察火山口的景色和获得对该火山口更为完整的印象。
还可从上述的不同地点乘坐快艇到火山口的湖中心去游览。从火山口的平面可以仰视高达300米的火山口悬崖和星罗棋布地散布在其中的带有蓝色窗户的白色建筑还有蓝色穹顶的教堂。如果想更靠近火山口去看个究竟，游客还可以乘坐
小型潜艇到火山口下的深水域去游览。