地层不整合（stratigraphic unconformity）是指上下两套不同时代地层之间出现过沉积间断或地层缺失的地层接触关系。地层不连续，古生物演化顺序也是不连续的，由此确定岩层的时代也是不连续的。

地层不整合是一种重要的构造现象。它反映构造运动的时期和构造运动的性质，是构造事件的重要标志。不整合总是以侵蚀面分开有一定时代间断的新、老两套地层，不整合面发展首先是较老地层的沉积，继之以地壳运动，并使老岩层暴露于地表遭受侵蚀，最后是较新地层的沉积。沉积与侵蚀作用可以交替发生，上、下两套地层间总是缺失一些时代的地层。地层剖面中的岩层是现存的地层部分，而地层不整合则是缺失的地层部分。

地层不整合可以分成角度不整合和假整合两类。前者是两套地层呈一定角度接触，中间为一侵蚀面（即不整合面），说明在前一套地层沉积后，有一次大的构造运动和海陆变化，然后地壳再次下沉又沉积了后一套地层。后者是两套地层大体呈平行接触，中间为一侵蚀面（即不整合面），说明在前一套地层沉积过程中有一次较大的地壳上升或海退运动以后地壳再次拗陷，沉积了后一套地层。

识别和鉴定不整合的证据：①地层自然记录缺失的间隔证据，包括古生物自然记录的间断和地层自然记录的间断。②侵蚀的证据，包括构造不一致和地形不规则。③古陆表面的证据，包括风化面、古土壤、底砾岩等。不整合研究具有广泛意义，它是造山幕建立或构造旋回划分、岩石地层单位划分的重要依据。

在地层不整合面附近存在大量油气藏，这些油气藏的形成与地层不整合面有着密切的关系。在前人研究的基础上，通过查阅大量文献，根据地层不整合的成因机制和地震反射率终止方式、不整合发育的部位及剖面形态等，可以将地层不整合划分为5种主要类型：褶皱不整合、断褶不整合、削截不整合、超复不整合、平行不整合。这些地层不整合对油气的运移、聚集都有着重要的影响：对油气聚集成藏既有建设性作用，又有破坏性作用。在不整合面上下可形成大量圈闭，改善了油气储藏条件，同时为油气的运移提供了优势通道，因此对油气成藏有着重大影响。