基因操纵子是细菌中与同一种生化功能有关的几个基因(如控制色氨酸合成的有关基因)在基因组内聚成一簇而紧密连锁，并受一个基因调控。基因操纵子只在细菌中发现。在真核生物基因组内很少发现，真核生物的结构基因一般是单独调控的，但真核生物中也有称为超基因的结构。

人类基因组的超基因如血红蛋白基因簇，位于16号染色体，跨度约30 kb，由编码血红蛋白的类。-珠蛋白的基因聚集成簇。位于2号染色体上跨度约60 kb给血红蛋白的类卢-珠蛋白编码的基因也聚集成簇。在个体发育的不同时期，基因簇中的不同基因进行表达。-珠蛋白基因簇中有3个假基因ψζ、ψα和ψα，类β-珠蛋白基因簇中也有一个假基因ψβ。