基底断裂（foundational fault，basement fault）是指切穿花岗质岩层基底，到达玄武岩层顶面的穿层断裂。

基底断裂（foundational fault）指切穿花岗质岩层基底，到达玄武岩层顶面的断裂称为基底断裂。

地质历史上基底断裂可按以下地质特征判断：

（1）沿断裂带有呈串珠状分布的酸性岩浆岩，也有少量的中一基性岩；

（2）出现线状或串珠状沉积盆地，其中与沉积岩同时发育的少量中酸性和酸性岩浆岩；

（3）温泉、湖泊线状分布等；

（4）是沉积岩相变化带、厚度梯度带，或为中一新生代沉积盆地的边界；

（5）对于地台区的沉积盆地和沉积盖层发育有重要影响。沿基底断裂有浅源地震活动和地球物理异常。基底断裂一般控制沉积岩的分带性和石油、天然气的分布。

基底断裂的延伸方向与元素地球化学场的特征线(如高低背景场梯度带以及高、低背景场轴线等)延伸方向一致，在两组断裂的交汇部位，元素地球化学场常常发生扭曲或变形，多组断裂的交汇部位的元素地球化学场大多近等轴状，基底断裂常常出现在两种特征地球化学场的突变带上。这些特征表明基底断裂对元素地球化学场具有控制作用。