复旦大学遗传学研究所，创立于1961年，前身是1956年8月青岛遗传学座谈会后在复旦建立的遗传学研究室，创始人是谈家桢院士，继任所长是赵寿元教授。

本所共有教职员工 101人，国家杰出青年4人。主要研究领域：人类医学遗传学、群体和进化遗传学、微生物遗传学、植物遗传学、发育遗传学和遗传工程。

遗传学研究所、遗传工程国家重点实验室与遗传学和遗传工程系以及生物技术中心相互依托、密切配合，成为全国遗传学重点学科。1997年遗传学科在教育部“211工程”一期建设中被评为重点学科建设项目。2002年遗传学科在教育部“211工程”二期建设中被评为重点学科。2007年遗传学科在教育部“211工程”三期建设中被评为重点学科。“211工程”和 “985工程”建设建立了多个技术平台，推动了遗传学科大发展，加速了遗传学科跨入一个新的台阶，进入了国际学术舞台。近五年来遗传学科在国际一流刊物 Science, Nature, PNAS, Genetics上发表 SCI论文335篇，。1997年薛京伦教授主持的基因治疗获国家技术发明奖二等奖。2000年余龙课题组获国家自然科学基金委首批科研创新团队。2007年金力教授主持的进化群体遗传学研究，获得国家自然科学二等奖。