外囊菌目（Taphrinales）是
真菌门、
子囊菌亚门、
半子囊菌纲的1目。C·L·克雷默（1973）主张本目仅包括外囊菌科1科，但也有人主张取消原囊菌目，将原囊菌科和外囊菌科作为外囊菌目的两个科。
无性繁殖主要是由
子囊孢子直接芽殖形成芽孢子，芽孢子可重复芽殖或萌发生菌丝体，但在人工培养基上不能形成菌丝体，只形成酵母状菌落。有性生殖由菌丝细胞双核化后形成产囊细胞，在产囊细胞内进行核配，此时细胞开始伸长并渐渐形成子囊，一般出现在寄主植物角质层下的栅状层中。
本目成员均为植物寄生菌，为害高等植物和蕨类植物，引起组织变形，如缩叶、皱叶、囊果、泡肿和丛枝等症状。其中著名的如引起桃缩叶病的
畸形外囊菌。外囊菌属的其他一些种还可引致栎树、樱桃的缩叶病；杨树、桃树的叶泡肿病；桦树、樱桃、李的丛枝病；李的囊果病等。
属半子囊菌，形态较简单，菌丝有隔、无色、分支，且都是双核菌丝，这最后一点在子囊菌中是特殊的。菌丝体只寄生于寄主
表皮细胞下或表面的角质层下，最后形成一层产囊细胞，从而发育成一层子囊，呈栅状排列于寄主表面。子囊一般呈圆筒状，内含8个子囊孢子。有时由于雌雄核融合后只进行减数分裂而不再进行有丝分裂，从而一个子囊只含4个子囊孢子。另外还有些外囊菌，子囊内的单倍核还会进行多次有丝分裂，因而形成许多子囊孢子。子囊孢子单核、单倍体，有时可在子囊内进行芽殖，产生芽孢子。子囊孢子和芽孢子成熟后被子囊喷射出去，然后随风传播。外囊菌除芽孢子外，无典型的分生孢子，无性世代不发达。
此目只有一科、一属，约120种，全部都是寄生菌，寄生性很强，接近于专性寄生，但可人工培养，在人工培养中只进行芽殖，象酵母那样。引起的主要病害有
桃缩叶病、李袋果病、樱桃缩叶丛枝病等。