多杰扎寺是
宁玛派在前藏的主要寺院之一。宁玛派是藏传佛教各教派中历史最久过错的一派，现任寺主为仁增钦摩·多杰扎·江白洛桑活佛，是
西藏自治区政协副主席、
中国佛教协会副会长。
多杰扎寺以传授“北藏”系统为主，附带也传授“三素尔”以来的一些佛教经典。宁玛派经典中的重要部分是“伏藏”，伏藏是从山洞或地下发掘出来的经典。约在12世纪时，宁玛派中就先后出现了挖掘伏藏的人，他们被称为“德敦”。其中著名的有娘·尼玛维色，他发掘的伏藏称为“上部伏藏”：古如·曲吉秋发掘的伏藏称为“下部伏藏”。在15～16世纪时，挖掘伏藏的热特那林巴将上下部伏藏和自己挖掘的伏藏汇集一起刻印，称为“南藏”；16世纪前期，后藏昂仁县日吾扎桑地方的一个贵族子弟仁增·敦吉登曲坚赞发掘出不少伏藏并刻印，称为“北藏”。“北藏”中有很多经籍都是原来经典和伏藏中所没有的，如《堪卓宁提》等。在这些伏藏中，有讲宁玛派传承的，有讲医学的，有讲吐蕃王朝时期历史的，其中较著名的有《五部遗教》、《莲花生遗教》等，对研究吐蕃历史有一定的参考价值。多杰扎寺专门弘传“北藏”系统的密乘经典，并认定仁增钦摩·敦吉登曲坚赞为该寺的第一世活佛。
宁玛派作为一个教派，它不像萨迦、噶举等其他教派，一直有一个中心寺院，而宁玛派却是分散发展的，也不像其他的教派那样和地方势力有比较密切的关系。宁玛派在元朝虽然和中央政权建立了联系，但由于宁玛派组织涣散，单线传承，故始终未形成一个稳定的寺庙集团势力。直到16世纪，在前藏才出现了较有规模的宁玛派寺院。特别是17世纪由于第五世达赖的支持，宁玛派在前藏的两座著名寺院（即：敏珠林寺、多杰扎寺）才有了显著的扩展，第五世达赖还专门兴建了一座寺院（南杰林寺）弘传宁玛派教法。1718年准噶尔蒙古军队侵扰西藏，多杰扎寺被摧毁，寺主仁增钦摩·白玛逞勒活佛等人被害。后由颇罗鼐地方政府资助修复。“文革”中又惨遭破坏。1984年政府拨专款进行了修复，现有喇嘛23人。
多杰扎寺供奉的神像奇特，主要有“出世五部”为修道成佛必须的“本尊”，有代表身语意的文殊、莲花、真实，代表功德和事业的甘露、金刚橛；“世间三部”为差遣非人、凶猛咒诅、供赞世神。非人原是西藏本教中的凶神，藏语称“玛摩”后被宁玛派吸收为护法神。其形象被描绘成黑色的既丑又忿怒的妇人，半裸，干瘪的乳房，结块的发辫；典型的兵器是疫病口袋、拘鬼牌、黑绳套和魔线球。最著名的护法女神是班丹拉姆，她是众玛摩之主。