天主教海门教区（Dioecesis Haemenensis）成立于1926年，是天主教在中国第一批由本国主教负责的教区之一。

清乾隆初年，外国传教士到崇明、海门传教。在天主教被查禁期间，这一带是天主教秘密传播的重要基地。19世纪末，信徒人数又有较大增加。1926年，教廷设立海门宗座代牧区，朱开敏神父升任代牧，10月28日在罗马晋牧。管理江苏省长江口北岸的崇明（包括启东）、南通、如皋、泰兴、靖江等县的教务。信徒有3万人，其中大部分位于崇明县。1946年，天主教在中国实行圣统制，海门代牧区改设正式教区。

1959年，海门教区实行自选自圣主教，郁成才当选为正权主教。1960年，主教公署自海门迁往南通。崇明县划归天主教上海教区。

海门教区是天主教在江苏省境内的4个正式教区之一（海门教区、天主教徐州教区、天主教南京教区和天主教苏州教区）。信徒有3万人，其中启东约15000人，海门约10000人。

耶稣善牧主教座堂（主任司铎：张越峰神父，司铎：高弟华神父）、狼山圣母堂朝圣地（主任司铎：顾洪健神父）、如东兵房圣若瑟堂（主任司铎：陈小平神父）、通州张芝山圣伯多禄宗座堂（在建）

海门耶稣圣心堂（主任司铎：陆惠柏神父）、三厂露德圣母堂（主任司铎：印泽忠神父）、临江圣路加堂（主任司铎：丁祖耀神父）、万年玫瑰圣母堂、刘浩圣三堂、三星圣若瑟堂

汇龙圣母圣衣堂（主任司铎：倪永飞神父）、南阳圣保禄堂（主任司铎：姚建辉神父）、希士耶稣圣心堂（主任司铎：施洪权神父）、曹家圣女小德兰堂（主任司铎：袁近涛神父）、新港圣玛弟亚堂（主任司铎：顾维新神父）、通兴圣若瑟堂、近海光荣十字架堂、向阳玫瑰圣母堂

北河下耶稣圣心堂（主任司铎：顾家昌神父，司铎：王喜乐神父、刘明见神父）、泰州光荣十字架堂、高邮圣若瑟堂、兴化圣家堂

朱开敏 1946年4月11日—1960年2月22日

袁文宰（圣名：马尔谷）1989年—2007年 1989年由范忠良主教晋牧，1990 年起软禁于南通狼山圣母堂内，1996 年恢复自由，2007年3月去世。

沈斌（圣名：若瑟）2010年至今 1970年出生，1996年晋铎，2009年3月选为海门教区主教，2010年4月21日由临沂教区房兴耀主教主礼，合法晋牧。