天津音乐学院音乐学系的前身是本院作曲系设立的音乐学专业，由老一辈音乐学家缪天瑞、许勇三、徐荣坤等教授于20世纪70年代末创建。1997年1月，音乐学系正式成立。历任系主任有高燕生教授、郭树群教授，现任系主任方建军教授，党支部书记靳建新。音乐学系现为教育部批准的“高等学校第一类特色专业”建设点，天津市“十一五”高校重点学科。
天津音乐学院音乐学系在教学中注重将科研成果向教学实践的转换，走教学、科研相结合的发展道路，不断加强学生的艺术实践和社会实践能力，培养了一批既有扎实的音乐理论基础，又有丰富的音乐艺术实践经验的复合型人才。
音乐学系现有西方音乐史和中国音乐史两门市级精品课程，一名市级教学名师（周小静）和一名天津市特聘教授（方建军）。专业教师16名，其中教授8名，副教授和讲师4名；教师中获得博士学位者3人，硕士学位者6人。
目前，音乐学系拥有专业图书资料室、多媒体教室和田野考察视听资料实验室，以供教学之需。2005年后还建立了“音乐学主题网站”，并逐渐形成了特色栏目，在学界产生了一定影响。