天然异交率是指后代中杂种个体所占的比率

作物在自然条件下，后代中杂种个体所占的比率。

其测定方法如下：

天然异交是与人工杂交相对而言的，是指同作物不同品种间的自然杂交。天然异交率的测定方法：通常是选择受一对基因控制的相对性状作为遗传测定的标记性状。以具有隐性性状的品种为母本，将父、母本等距、等量隔行种植，任其自由传粉结实，然后将母本植株上收获的种子播种，进行后代苗期性状的测定。如果测定的性状为种子性状，表现花粉直感，则当代母本植株上收获的种子(已是F1代)可直接进行测定。计算出F1中显性个体出现的比率，就是该品种的天然异交率。

天然异交率=（ F1中显性性状个体数/ F1总个体数）×100%

也有人把上述结果乘以2，作为实际的天然异交率。这是因为同品种的植株间，也有同样的天然异交机会，只是由于性状相同而不能测定出来而已。

很多因素会影响天然异交率，如株行距大小、种植方向、风向和风力、温度和湿度、降雨以及传粉昆虫的数量等。作物本身品种间的差异，如开花期、开花习性、杂交亲和性等，对授粉也有影响。因此，要在不同年份、地区、不同品种重复测定，才能获得作物异交率的真实情况。