好氧降解，是指在有氧的条件下，利用好氧微生物将环境中有机大分子化合物分解为小分子物质的过程。一般情况下，微生物对多环芳烃的降解都是需要氧的参与，产生加氧酶，在加氧酶的作用下使苯环分解。其中真菌主要产生单加氧酶，首先进行多环芳烃的羟基化，把一个氧原子加到多环芳烃上，形成环氧化合物，接着水解生成反式二醇和酚类。

而细菌一般产生双加氧酶，把两个氧原子加到苯环上形成双氧乙烷，进而形成双氧乙醇，接着脱氢产生酚类。不同的途径会产生不同的中间产物，其中邻苯二酚是最普遍的。这些中间代谢产物经过相似的途径降解：苯环断裂；丁二酸、反丁烯二酸、丙酮酸、乙酸或乙醛等中间物质都能被微生物所利用，同时产生水和二氧化碳。