妙蛙种子是一只外表类似蟾蜍的四足的宝可梦。它有着鲜红色的眼睛、白色的瞳孔与巩膜，头顶上长着一对凸起的耳朵。它的鼻子短而钝，且有一张大嘴。当它的嘴巴张开时，可以看到上颚的一对小而尖的牙齿。它的皮肤呈蓝绿色，并附有深绿色的斑纹。它每条粗腿的脚掌上都分出三趾，且末端都长有白色的小爪子。
据说在妙蛙种子出生的时候，它的背上就种有一个会和它身体一同成长的神奇种子。种子里储存着营养，所以它即使好几天不吃东西也可以活得好好的。在它出生后的一段时间内，它会吸收背上种子里储存着的营养成长。有时会看到它在太阳底下睡午觉的样子。在沐浴了充足的阳光后，它背上的种子就会茁壮成长。
妙蛙种子可依次进化为妙蛙草、妙蛙花。如果训练家持有
钥石且妙蛙花携带着妙蛙花进化石，那么训练家在战斗中还能令妙蛙花
超级进化为超级妙蛙花。
在游戏《宝可梦 红·绿》、《
宝可梦 蓝》、《
宝可梦 火红·叶绿》中，关都地区的最初的伙伴是妙蛙种子、小火龙、杰尼龟。在游戏《
宝可梦 皮卡丘》中，关都地区的最初的伙伴是皮卡丘。在游戏《
宝可梦 Let's Go! 皮卡丘·Let's Go! 伊布》中，关都地区的最初的伙伴是皮卡丘、伊布。