孔府文物档案馆，是曲阜市集文物收藏、研究和展览为一体的综合性博物馆，共保存有新石器时代至明清时期的陶器、玉器、青铜器、字画等文物10万余件，孔府档案25万余件。2009年9月，孔府文物档案馆被
国家古籍保护中心授予“全国重点古籍保护单位”荣誉称号，同时其馆藏古籍元董真卿撰、元刻本《周易经传集程朱解附录纂注》十四卷、《朱子易图附录纂注》一卷《朱子启蒙五赞附录纂注》一卷、《朱子筮仪附录纂注》一卷和明徐养正辑、明嘉靖刻本《二程先生粹言九卷》成功入选国家古籍保护中心公布的第二批“国家珍贵古籍名录”。
孔府档案起于明嘉靖十三年（1534年），止于1948年。档案数量计9025卷、约25万件。档案内容十分丰富，大致分为宫廷、朝廷整治、文书、祀典、袭封、宗族、林庙管理、属员等类。孔府档案以其时间长、数量多、内涵丰富、历史久远而成为中国著名的私家档案，是研究孔府的重要资料，也是研究中国封建社会的珍贵原始资料，具有很高的历史价值。孔府档案为中国文献学提供了一个特有的典型范例，在档案史上也占有重要地位。