孙宜长子。少负文名，生质颖异，七岁能赋诗，十四岁试异等补博士弟子员。其一生博览群书，著书立说，遍游海内名山大川，广泛结交天下贤豪之士，与太仓
王世贞、云间
袁福徵、
姑苏皇甫子循、西湖徐子与、豫章余德甫、
淮河陈玉叔、平江艾和甫等交往甚密。自称所历天下郡国十之五、所探名山水十之七、所交天下贤豪大夫士十之九。斯亿 “学无所不窥，自经籍子史外，逮天官、形家、国纪、家乘、稗官、二氏之说，靡不通晓”。著有《鸣铗集》、《浮湘稿》、《中州北游稿》等数十卷，协助钟崇文纂修隆庆《岳州府志》十八卷（现藏天一阁）。
明代文坛给孙斯亿的评价很高。
王世贞评价 “其议论盘礴经史”，“得其集览之渊然之光，而读之若叩金石，又若苍虬舞而应龙啸者”。明太史
黄辉称其“因尽读家所藏书，下笔娓娓不休”，“文法史汉，诗步盛唐，尤工汉魏古诗、乐府”。湖广督学董其昌评价“德范如陈太丘，诗名若孟襄阳”。
礼部尚书李维桢认为“斯亿博学宏词，为布衣雄长”。