曾与
李少春、
杜近芳、
袁世海、
黄正勤、
李崇善等人合作。曾参加“正社”组织的红旗青年京剧团，与
那正鑫、
关正明、
程正泰、
陆正红、陆正梅、朱正琴、
张正芳等师兄弟、师姐妹合作，在红旗青年京剧团时获得各界好评。解放后在
上海京剧院工作，曾在现代戏《
磐石湾》中饰演黑头鲨（后拍成电影）。孙正琦还曾随
李少春等人出访欧洲，
抗美援朝时也曾在朝鲜慰问演出。
与
王金璐在
上海京剧院首演《雁荡山》，饰贺天龙，王金璐饰孟海公。孙正琦先生还为其师妹
张美娟先生配戏和排戏，配戏剧目如：《打瓜园》、《打焦赞》、《擂鼓战金山》等，新排练的剧目有《八仙过海》等。