自1999年成立以来，宁波出入境检验检疫局各项工作取得了跨越式较快发展和显著成效。宁波出入境检验检疫业务量约为“三检”合一之初的5倍，占全浙江省检验检疫业务量的50%，位列全国35个直属检验检疫局前10位。检验检疫是技术执法部门。宁波检验检疫局始终高举“科技兴检”大旗，先后投入2亿多元资金用于实验室和改善检测设施建设，全系统共有7个国家级重点实验室、6个区域性中心实验室等检测机构，科研检测实力在全国系统中的地位不断上升。宁波检验检疫局通过依法行政、依法施检，有力地维护了宁波口岸安全、卫生、环保和健康，累计截获各类疫病8000多例、疫情约2700种次、不合格商品2万多批（次），涉及金额130多亿美元；有效地防控了非典、高致病性
禽流感、疯牛病、TCK、
松材线虫、甲型H1N1流感等重大疫情疫病传入传出；有力地堵截了国外苏丹红、高放射性物质、孔雀石绿等有毒有害物质的侵入。长期以来，宁波检验检疫局不断深化自身改革，努力优化服务，把深入推进“大通关”建设作为努力实践“三个代表”重要思想、深入学习实践科学发展观、加强执政能力建设的具体行动，以促进地方经济发展为己任，密切关注区域经济发展的特点和外贸需求，加快了电子检验检疫体系建设步伐，率先构建了进出口企业信用管理体系，推出深化检验检疫监管模式改革、建立检政、检关、检贸、检港、检检合作等多方协调机制等一系列有力举措，充分发挥检验检疫技术、政策、信息等优势，帮扶企业渡难关、攻壁垒、促转型、提质量，为营造良好的宁波投资软环境和扩大出口发挥了重要作用，自2001年起，连年被地方政府授予
开放型经济优秀服务奖。在强化检验检疫、卫生注册、认证监管的同时，宁波检验检疫局积极推行国际认证，认证种类已覆盖ISO九千、ISO一万四、OHSAS一万八、QS九千、HACCP等，有力地促进了全省全市外贸企业“以质取胜”战略的实施，增加了国际市场竞争力。
建局以来，宁波检验检疫局党组勇立潮头，以人为本，科学发展，形成以“出入有境、服务无境”的宁波国检精神为核心，以精神理念文化、制度行为文化、表层形象文化三层的同心圆文化体系，并将历年来的发展经验转化为宁波检验检疫事业发展的强劲动力。
坚持不懈地开展机关党建“五个一”活动，连续六年被宁波市委授予机关党建工作先进单位，局机关党委2次被评为全国质检系统优秀基层党组织；坚持不懈地推进了文明创建和党风廉政体系建设，先后被授予“宁波市文明单位”、“浙江省文明单位”、“宁波市文明行业”和“全国精神文明建设先进单位”。
宁波检验检疫局还在机关内部管理中导入ISO九千
质量管理体系，取得国际认可的CQC和IQNET ISO九千双认证证书。