寡核苷酸(Oligonucleotide)，一般是指2~10核苷酸残基以磷酸二酯键连接而成的线性多核苷酸片段，但在使用这一术语时，对核苷酸残基的数目并无严格规定，在不少文献中，把含有30甚至更多核苷酸残基的多核苷酸分子也称作寡核苷酸。寡核苷酸可由仪器自动合成，它可作为DNA合成的引物(Primer)、基因探针(Probe)等，在现代分子生物学研究中具有广泛的用途。

寡核苷酸使用从核苷酸俗名派生的前缀名来命名。

例：2′-脱氧鸟苷酰基-(3′→5′)-2′-脱氧尿苷酰基-(3′→5′)-2′-脱氧鸟苷

（2′-deoxyguanylyl-(3′→5′)-2′-deoxyuridinylyl-(3′→5′)-2′-deoxyguanosine）。

寡核苷酸极易与它们的互补对链接。

寡核苷酸常用来作为探针确定DNA或RNA的结构，用于基因芯片、电泳、荧光原位杂交等过程中。

寡核苷酸合成的DNA（脱氧核糖核酸）可以用于链聚合反应，能放大确定几乎所有DNA的片段，在这个过程中寡核苷酸是作为引物，和DNA 中标记的互补片段结合，作成DNA的复制品。

调控寡核苷酸用于抑制RNA片段，防止其翻译成蛋白，在制止癌细胞活动方面能起一定的作用。