小麦黑颖病是由甘蓝黑腐病黄单胞菌的致病变种引起的、发生在小麦的病害。主要发生在穗部，也能侵染茎和叶部。小麦穗部染病，颖壳上生褐色至黑色条斑，多个病斑融合后颖壳变黑发亮。颖壳染病后感染种子，轻者种子颜色变深，重者种子皱缩或不饱满。叶片、叶鞘染病，沿叶脉形成黄褐色条状斑。穗轴、茎秆染病产生黑褐色长条状斑。湿度大时，病部产生黄色菌脓。

在19世纪后期的文献中，就有对以黑颖为特征的病害进行过讨论。至1919年，人们把小麦黑颖病归入细菌性病害。该病在世界范围内都有发生。小麦黑颖病的危害性显然是微不足道的，即使症状很明显，影响也不大。毁灭性的流行极少，资料也很少，这说明该病没有引起人们的重视。

小麦黑颖病病原为甘蓝黑腐病黄单胞菌的致病变种（学名：Xanthomonas Campestris pv. translucens (Jones、Johnson ＆ Reddy) Dye），属假单孔细菌目、黄单胞菌属真菌。杆状菌，长0.5-1.0微米，单根极鞭，革兰氏阴性反应，好气性，在培养基上产生一种非水溶性的黄色色素，在牛肉汁培养基上，菌落生长缓慢，淡黄色，中央凸起，光滑，有完整的边缘。病菌有寄主专化型，为害小麦的为小麦专化型（学名：Xanthomonas Campestris pv. translucens f. sp. unclulosa），另外还有为害大麦、黑麦等专化型。

小麦黑颖病主要发生在穗部（包括颖、种子和芒），也能侵染茎（茎秆和穗轴）和叶部：

有些小麦品种的黑颖是品种的遗传特征（如墨西哥系统的品种），这种情况要与一般的小麦黑颖病加以区别。

初次侵染来源主要是带菌种子。病菌在贮藏的小麦种子上可以生活3年之久，在残株上也能存活，但残株腐烂后即死亡。病菌在土壤里不能存活。病菌由带菌种子进入导管，最后达到穗部，形成病斑。病斑上产生的菌脓含有大量的病原细菌，能借风雨、昆虫和接触传播，进行再传染。

高温高湿可促进小麦黑颖病流行，但低温会延长小麦生育期，也会加重发病。地头、缺株地段的小麦植株，因生育期延长，往往发病也较严重。