山西省食用菌工程技术研究中心依托山西农业大学食品工程学院的微生物学、真菌学、细胞学、发酵学等优势学科以及山西农大相关学科的1个博士点和4个硕士点组建而成。由
山西省教育厅、科技厅于2004年8月30日正式批准成立，是我省2004年首批8大工程技术研究中心之一。研究方向为真菌和食用菌资源调查研究，食用菌栽培技术研究，食用菌病虫害研究，食用菌产品加工利用研究，食用菌产品营养分析和卫生检验研究。
中心在真菌分类、食用菌资源调查、食用菌栽培及技术推广和食用菌病害研究方面，在我国处于先进水平，有较强的技术推广能力，有十几个系列开发产品和20多项应用新技术。主要著作有《食用菌栽培》、《食用菌栽培学》、《中国真菌志》第七卷、《现代食用菌基础理论及栽培新技术》。“黄土高原代料栽培香菇”获山西省农村技术承包一等奖、“稀土在食用菌上的应用”获省科技进步二等奖。在山西安泽县建立了全省最大的香菇生产基地，在清徐县建立了全省最大的白灵菇生产基地，在全省20多个县市进行了食用菌科教兴农服务工作。
目前主要在研的项目有山西省攻关项目“珍稀菇类—茶树菇、姬松茸、灵芝研究开发利用”；省留学基金“生物转化料土栽培食用菌高产技术研究”、“山西核菌资源及其菌种库的建立”；省青年基金“钙激活酶激活蛋白的克隆与表达”。