崧泽遗址位于上海市青浦县城东约4公里处，地处太湖地区，是中国长江下游地区以新石器时代为主的遗址。

1957年，崧泽遗址在上海市青浦区赵巷镇崧泽村被上海市文物保管委员会考古调查时发现，其历史可上溯至距今6000年前的马家浜文化，是上海地区最早的人类居住地之一。

1958年，上海市出版局饲养场在村北挖掘鱼塘又发现了鹿角、陶片和石器，从而认定该处存在古文化遗址。

1960年，上海市文管会在该地进行了小范围的试掘，在假山墩上发现了丰富的新石器时代遗存。

1961年，上海市文管会在夏天进行了第一次有计划的发掘，发掘面积458平方米。

1974年—1976年，上海市文管会又一次进行有计划的发掘，面积202平方米。

1994年—1995年，上海市文管会再次对遗址进行发掘。

2004年，在崧泽遗址发现了比较完整的被誉为“上海第一人”和“上海第一病“的马家浜晩期男性头盖骨和房屋基址。

崧泽遗址位于上海市青浦区赵巷镇崧泽村，在中心城区东五公里处，其北紧临沪青平公路，东距北干山5公里，青平公路从遗址的北部经过。崧泽村地势低洼，河道纵横，村北有一个长宽各约90米，高约4米的土墩，称“假山墩”。遗址以假山墩为中心，遗址面积约15万平方米，东西长约500米，南北宽约300米。发掘得知崧泽遗址的文化堆积丰富，由下到上依次为马家浜文化、崧泽文化和青铜时代遗存。

崧泽遗址文化堆积由下到上依次为马家浜文化、崧泽文化和青铜时代遗存。

崧泽遗址上层发现的春秋战国时代的硬陶豆、硬陶罐，原始瓷盒与瓷豆，以及拍印字纹、曲折纹、斜方格纹、米筛纹和米字纹等印纹硬陶陶片，与金山县戚家墩遗址出土的陶瓷器特征大致相似。

崧泽遗址中层发现136座墓葬按墓位分布现象有东北、北、西北、南和西部5个墓群，是一处氏族墓地。埋葬方式是将人体平放在地上，堆土掩埋。人骨仰身直肢，头向东南周围放置数件生前使用的斧、砗等石器和鼎、豆、罐、壶、杯等陶器。有的人骨口内还有玉，颈部佩戴玉璜，手臂上有玉镯，与黄河流域挖土坑埋葬的习俗不同。

崧泽遗址下层是新石器时代马家浜文化的村落遗址，在下层村落遗址中，发现了古人使用的石斧、玉和夹砂红陶釜陶炉箪以及泥质红陶豆和盆等器物。

崧泽文化是中国长江三角洲地区的新石器文化，崧泽文化的命名主要根据20世纪六七十年代的两次发掘的成果而于1979年定名。分布范围以太湖平原为中心，西起镇江一带，北达通扬运河，南至杭州湾北岸。年代为公元前4000至前3200年左右。在遗址发现有水井遗迹，崧泽文化早期玉器基本延续了马家浜文化晚期玉器的风格，所见器型仍较单调，以块、璜为主，但玉钺等突破装饰品范畴的新器形也偶有所见。崧泽文化的前身是马家浜文化，其后继者是良渚文化。

崧泽遗址的发现，对研究中国长江中下游人类发展史，特别是太湖地区的原始文化和上海地区的古代史，提供了重要的资料。崧泽遗址出土了一定数量春秋战国时期的青铜矛、青铜钺、青铜削等兵器、农具和小型工具，丰富了上海地区先秦时期青铜器的种类，具有较高的研究价值。

崧泽遗址马家浜文化籼稻的发现与崧泽遗址孢粉分析研究的结果相一致，出现的不同稻属则证明古代农作物栽培技术的进步和发现的可人工培植的籼稻和粳稻的谷粒，证明了当时的气候条件，湿热的气候适合水稻的栽种，说明水稻在新石器时代已是本地区的主要农作物，证明该地的先民在距今6000年左右已掌握了水稻种植技术，人们也能较普遍地食用稻米，更证明了中国是世界上最早栽培水稻的国家。从崧泽遗址中发现的一只圆咕隆咚的典型的家猪模样的陶塑小猪，将上海地区驯化猪的历史向前推进到了6000多年前，此前的考古结果都表明人类家猪驯化史只有5000多年。 崧泽遗址中出土的“上海第一人”头骨，为研究上海地区古人类发展提供了极其宝贵的原始资料，“上海第一屋”说明6000多年前的上海先民已经不再风餐露宿。

2011年，上海开建崧泽遗址博物馆，选址上海崧泽遗址所在地青浦区赵巷镇崧泽村，总用地约1.3万平方米，总建筑面积3680平方米。

2014年，崧泽遗址博物馆开始开放，如古老村落的缩影，以小桥、流水、村落和庭院组合将现代与历史结合。

2013年3月5日，崧泽遗址被中华人民共和国国务院公布为第七批全国重点文物保护单位。

2021年10月，入选为“百年百大考古发现”。

崧泽遗址位于上海市青浦区赵巷镇崧泽村，在中心城区东五公里处，其北紧临沪青平公路。

从上海市青浦区出发经沪朱专线到达崧泽遗址。