工业微生物湖北省重点实验室于2001年立项建设，该实验室前身是发酵工程实验室，为湖北工业大学重点实验室。实验室围绕“天然产物的生物制造”、“生物大分子的生物制造”和“传统发酵过程的现代改造”3个研究方向开展研究工作。下设3个研究室、1个分析测试中心和1个中试基地，拥有总面积为1万余平方米的实验室和产学研中试基地，仪器设备总值近4千万元。实验室汇聚了毕业于美国麻省理工学院、康奈尔大学，英国牛津大学、威尔士大学以及国内知名高校的一批年轻学者。

工业微生物湖北省重点实验室于2001年立项建设，该实验室前身是发酵工程实验室，为湖北工业大学重点实验室，发酵工程学科于1991年作为省级重点学科，于1997年评估验收。同时工业微生物湖北省重点实验室于2005年顺利通过湖北省教育厅验收评估。2008年申请成立发酵工程教育部重点实验室，2010年10月重点实验室通过教育部立项建设验收。

中国工程院院士杨胜利担任实验室学术委员会主任。实验室主任由“楚天学者”、中科院武汉病毒所博士生导师汤亚杰教授担任。

实验室围绕“天然产物的生物制造”、“生物大分子的生物制造”和“传统发酵过程的现代改造”3个研究方向开展研究工作。下设3个研究室、1个分析测试中心和1个中试基地，拥有总面积为1万余平方米的实验室和产学研中试基地，仪器设备总值近4千万元。

实验室汇聚了毕业于美国麻省理工学院、康奈尔大学，英国牛津大学、威尔士大学以及国内知名高校的一批年轻学者。固定研究人员共42人，其中教授20人、副教授16人、讲师3人；32人具有博士学位，其中留学回国博士、博士后11人。拥有“新世纪百千万人才工程”国家级人选1人、湖北省“楚天学者”计划特聘教授4人、楚天学子1人、湖北省有突出贡献中青年专家3人、4人享受省政府特殊津贴，湖北省自然科学基金创新群体1个、湖北省高等学校优秀中青年科技创新团队3个、湖北省自然科学基金青年杰出人才1人，武汉市人事局创新岗位特聘专家1人。立项建设以来实验室共招收硕士研究生141人、已毕业103名，联合培养博士生4名。近两年来，先后承担承担各级各类科研项目127项，其中国家级项目17项、省部级项目33项、横向项目77项，项目总经费逾2200万元。共获省级科技奖励3项；申请发明专利33项，其中授权6项；发表学术论文290篇，其中SCI/EI收录59篇；鉴定成果7项；获省部级教学成果奖1项；出版专著、教材8部。

实验室先后与发酵行业的骨干企业建立了六个校企合作研究平台，在技术改造及新产品开发方面开展了卓有成效的合作。为企业解决了一系列技术难题，培训了一批技术骨干，提供了一批具有自主知识产权的新技术和有市场竞争力的新产品，为企业创造了良好的经济效益。

实验室十分注重学术交流，坚持定期邀请国内外知名专家学者来实验室做学术报告，先后邀请来实验室讲学的专家学者达19人次，国际知名专家有如：美国两院院士、麻省理工学院(MIT)学院教授Daniel I. C. Wang博士、加拿大皇家学会院士Murray Moo-Young博士、英国皇家科学院院士、牛津大学Allen Hill博士、日本静冈大学康部满康博士等，加拿大皇家学会院士Murray Moo-Young博士受聘我校名誉教授。在积极邀请国内外著名专家讲学的同时，实验室还积极派遣学术人员参加国内外各项大型学术交流，先后有65人次应邀外出讲学或参加学术会议，7名研究人员分别到澳大利亚、加拿大、日本等等高等学校和研究机构学习和从事研究工作。