广东省发酵与酶工程重点实验室依托于
华南理工大学生物科学与工程学院。于2005年立项 ，建设期为：2005年——2008年。
主要围绕
工业生物技术的核心－发酵与酶工程应用技术，以新生物质能源和化工产品开发为工程目标，结合生物信息学、分子进化技术、组合微生物技术和新型发酵技术开发，完善酶分子进化－工程菌筛选－催化过程（发酵优化为一体）的高通量、高效率工业生物催化体系筛选、优化及产业化技术体系，重点解决研究体系中工业生物技术中的理论问题。
1. 极端发酵体系宿主菌的筛选和机制研究；
2. 基于生物信息学的选择性大分子研究；
4. 重要工业酶生产技术。