广东省足球运动中心下设竞赛部、技术部、行政部、科医部和
办公室。广东省足球协会是
中国足球协会团体会员，下设竞赛委员会、新闻委员会、裁判委员会。广东省足球运动中心、广东省足球协会是一套班子、两块牌子。
广东省足球运动中心、广东省足球协会以
邓小平建设
中国特色社会主义理论为指导，按照
“三个代表”重要思想的要求，坚决贯彻执行省领导对足球工作的指示精神，认真完成了
中国足协和省体育局下达的各项工作和所有的竞赛任务，中心以青少年足球工作为重点，为全运、
奥运培养优秀后备人才；以规范职业
俱乐部建设为切入点，强化职业素质教育；以
竞赛为杠杆，大力开展青少年足球比赛，不断繁荣竞赛市场；以创新精神，规范全国足球联赛（广东赛区）工作；以重大比赛和活动为抓手，促进足球产业、足球文化比翼双飞；以足球运动管理体系法制化和规范化，管理人员综合素质不断提高为目标，求得新发展，开创新局面，取得新成绩，努力实践建设体育强省的工作目标。