嘉靖三十三年甲寅（1554）乡绅陈明扬捐修。天启四年甲子（1624），李荣照、陈金枝居士又修，周以云墙为护，凿水穿泉，疏池立桥，曲径回廊，叠古为山，环花木。时建相报殿大学士张瑞图。书曰“旷代号称名胜地；观光重到高山亭”。清初兵毁。乾隆五十九年甲寅（1794）乡钟耆李开祥、苏质彬、吴业森、陈德滋等捐题重新。道光二十二年（1842）僧解勤募化修葺，始改今名。光绪二十七年女居士赖素姑发愿重修，足寺，复赖会初，会泉靖法师为之策划，善友信士随喜襄助，遂将旧构抵扩大鼎新，即成单檐歇山式三开间二进，并修建护厝等。于是赖素姑亦落发出家，主持佛事。基间，慕道依止者渐众，盛时多至五十余口，光后购置田产25亩，并领僧众耕耘，实现生产自救。
1956年又再次修缮寺宇，修建厢仿以及创建普同塔等，至此规模初具。素姑寿踌八十八。圆寂后，即由孙女李莲藏贞姑接砵传灯。1966年圮毁，1986、87年间，世界佛教协会主席、新加坡普觉寺住持宏般长老，不忍心于庆莲寺的破损，重修此寺。时有宏船法师的旅星俗家弟子朱金卜，朱国桢昆仲率先捐题，而李继猛、李友福、李亭店、苏金印、杨柱水、林淑好、朱信、李立谦等善信也解蘘举善，庆莲寺终于1987年5月间修整一新，
中国佛教协会池店镇禅堂、僧舍、普同塔等雄伟壮观，气派非凡。常住僧尼二十多人，精勤解道，德化遐布，声盖华美。现为县级文物保护单位。
庆莲寺地理位置持佳，泉安公路横贯南北。放眼平畴，稻畦鳞次，黛色烟鬟，如列户牖，萃于斯寺，真个是“独上高山路不赊，庆莲情系外阳斜。纠循步水泥路，蹴踏。廻异地花。一径通幽迷客眼，数声钟声是禅家。重重庙宇香亮，郁郁丛林笼碧纱”。