序列多态性（sequence polymorphism）是指在特定的基因座上的DNA片段中，出现了碱基变异的等位基因，不同的个体，不同的等位基因表现出碱基序列的不同，并能按孟得尔遗传规律从亲代遗传给子代。碱基错配的结果—形成碱基序列的变异-构成DNA序列多态性。指特定的基因座。