异源双链是由不同亲本双链分子中的互补单链产生碱基配对形成的双链DNA，可在细胞内基因重组中产生，也可在体外复性的条件下形成。

异源双链分析是由于突变和野生型DNA形成的异源杂合双链DNA存在碱基不配对区，可以形成环形不配对的部分，在非变性凝胶中电泳时，会产生与相应的同源双DNA不同的迁移率。该法与SSCP相似，是一种筛选突变的方法，所不同的是SSCP分离的是单链DNA，异源双链法分离的是双链DNA,也只适合于小片段的分析，但对一些不能用SSCP检出的突变有互补作用，两者结合使用，iU使突变检出率提高到近100%。