异质细胞heterocyst 亦称异型细胞是杂混于蓝藻类的丝状形态结构种类的体细胞（颤藻除外）中的一种特殊细胞。与营养细胞不同，缺少光系统I。此类细胞一般透明，有细胞内含物。它们的分布和形态是蓝藻分类的重要指标。开始形成时与体细胞是通连的，但不久在体细胞的一个区段的内侧形成第二胞壁，仅在前后二端与邻接细胞的接触部位残存有原生质连丝。

以后在该处又形成具有种的特异性的闭塞物（polar nodnle），这时细胞内含物变为透明。在生物学上的作用还不清楚，但在鱼腥藻中（Anabaena hallensis）有时从异质细胞的内含物形成藻殖段。由此看来，它可能就是生殖细胞的母体，这样称为异质细胞便无甚意义了。此外凡具有固氮能力的蓝绿都具有异质细胞。