他从小聪明好学，酷爱算术。一生从事数学研究，造诣很深。“
百鸡问题”是中古时期，关于不定方程正整数解的典型问题，邱建对此有精湛和独到的见解。著有《张丘建算经》3卷。后世学者北周甄鸾、唐李淳风相继为该书作了注释。刘孝孙为算经撰了细草。算经的体例为问答式，条理精密，文词古雅，是中国
古代数学史上的杰作，也是世界数学资料库中的一份遗产。
《张丘建算经》约成书于公元466—485年间，共三卷93题，包括测量、纺织、交换、纳税、冶炼、土木工程、利息等各方面的计算问题。其体例为问答式，条理精密，文词古雅，是中国古代数学史上的杰作，也是世界数学资料库中的一份宝贵的遗产。后世学者北周甄鸾、唐李淳风相继为该书做了注释。特别是唐代，经太史令
李淳风注释整理，收入《算经十书》，成为当时算学馆先生的必读书目。《张丘建算经》现传本有92问，比较突出的成就有最大公约数与最小公倍数的计算，各种
等差数列问题的解决、某些不定方程问题求解等。「
百鸡问题」是《张邱建算经》中的一个世界著名的不定方程问题，它给出了由三个未知量的两个方程组成的不定方程组的解。
百鸡问题是：「今有鸡翁一，值钱五；鸡母一，值钱三；鸡雏三，值钱一。凡百钱买鸡百只，问鸡翁母雏各几何。」依题意即解。
自张丘建以后，中国数学家对
百鸡问题的研究不断深入，百鸡问题也几乎成了不定方程的代名词，从宋代到清代围绕百鸡问题的数学研究取得了很好的成就。
夫学算者，不患乘除之为难。而患通分之为难。是以序列诸分之本元，宣明约通之要法，上实有馀为分子，下法从而为分母，可约者约以命之，不可约者因以名之。凡约法，高者下之，耦者半之，奇者商之，副置其子及其母，以少减多，求等数而用之。若乃其通分之法，先以其母乘其全，然后内子母不同者，母互乘，子母亦相乘。为一母，诸子共之，约之通分而母入者，出之则定。其夏侯阳之方仓，孙子之荡杯，此等之术，皆未得其妙，故更造新术，推尽其理，附之于此。余为后生好学，有无由以至者，故举其大概，而为之法。不复烦重，庶其易晓云耳。清河张丘建谨序。