徐祺恒曾就读于
中国江苏省三条巷小学，六年级时，因游泳成绩突出，被选拔进入江苏省少体校进行专业训练。
2011年10月20日，在
江西省奥林匹克体育中心游泳跳水馆举行的
第七届全国城市运动会游泳比赛在男子4×200米自由泳接力决赛中，徐祺恒与队友
王鑫、王一帆、
钟秋实组成的南京队以7分27秒96的成绩获得亚军。
2012年4月4日，在浙江绍兴举行的
全国游泳冠军赛男子4X200米自由泳接力决赛中，徐祺恒与队友
钟秋实、王一帆、刘建平合作以7分24秒48的成绩为江苏队夺得亚军。
2017年9月1日，
第十三届全运会游泳比赛男子200米自由泳决赛，江苏选手徐祺恒以1分48秒03获得季军。
2017年10月1日，国际泳联短池世界杯香港站男女混合50米自由泳接力，由
张麒斌、徐祺恒、
张雨霏、
沈铎组成的中国队以1分33秒41夺得季军。