微体古生物分析是利用不同倍率的显微镜或电子显微镜对沉积物中的形体微小的生物化石进行分析的方法。

专门研究和分析微体古生物或大生物体的某些微小部分。这种分析一般需要用各种处理方法将微化石切制成薄片或者是从岩石中析出，然后在显微镜下观察研究。由于微体古生物体形微小、数量多、分布广，故划分地层和对比地层时被广泛地应用，同时，对研究古气候学、古海洋学和古地理环境有重要意义。