公元338年，后赵石虎大举进攻鲜卑慕容部，兵势强劲慕容皝属下诸城多有降者，慕容皝一度动摇欲放弃棘城。慕舆根劝谏慕容皝：“不要被石虎兵威所迷惑，要坚守棘城挫敌锋芒以待战局变化。”之后赵兵四面蚁附攻城，慕舆根等昼夜力战终于击退赵军。
公元339年，慕舆根为折冲将军与前军师慕容评、广威将军
慕容军、荡寇将军慕舆泥袭击后赵辽西，俘获千馀家。后赵镇远将军石成、积弩将军呼延晃、建威将军张支等追击燕军，慕舆根等击败追兵，杀死呼延晃、张支。
公元344年二月，慕容皝命慕舆根等率兵三路，攻克宇文氏都城
紫蒙川（今辽宁朝阳西北）等要地，大破宇文部。
公元346年正月，
慕容皝派慕容军、
慕容恪、慕舆根等率领一万七千名骑兵，奔袭扶余国。慕舆根和众多将领一样，亲冒矢石，大胆进击，一举攻克
扶余，俘走扶余国王。
公元349年，石虎死后赵大乱，慕容皝欲攻取中原因而争取部下意见。慕舆根发言认为后赵内乱时机难得，同时燕国经过几代招贤养民，务农训兵国力已经充实，坚决主张进取中原。
公元350年，燕王慕容俊率领慕舆根等在追击后赵征东将军邓桓于鲁口时，遭到邓桓部将鹿勃早反击。鹿勃早率数千人夜袭燕军，燕前锋都督慕容霸部首先遭到袭击，慕容霸奋力抵抗才使燕军不致溃败。鹿勃早攻势甚锐燕王慕容俊一度准备撤军避之，慕舆根劝止慕容俊后，亲自发动反击终于消灭敌军。
公元352年，慕舆根参与围攻邺城。时中山（今河北定州）苏林纠众，起兵于无极（今河北无极东），自称天子，大刀阔斧，欲建“
国中之国”。闰十月，燕主慕容俊慎重决断，派出老成善谋的慕舆根前去支援主帅
慕容恪作战。经过多日苦战，克敌制胜，计斩苏林。
后来慕舆根自恃功高，目无君上，忌贤妒能。公元360年正月，伺机作乱挑拨慕容恪与慕容暐的关系，但被燕主
慕容暐识破，并派
皇甫真、
傅颜平乱而捕之。