顺治七年（1650）小金川归附；雍正元年（1723）置小金川长官司，乾隆四十一年（1776）改置美诺直隶厅；四十八年（1783）更名，设同知。
历史沿革
顺治七年（1650）小金川归附。
康熙六年（1667）大金川归附。
雍正元年（1723）置小金川长官司，大金川安抚司。
乾隆四十一年（1776）改置美诺直隶厅，阿尔古直隶厅。
乾隆四十四年（1779）阿尔古直隶厅并入美诺直隶厅，美诺直隶厅下辖底木达屯更名为抚边屯，裁大板昭屯入。
乾隆四十八年（1783）更名为懋功屯务厅，设同知。
乾隆五十年（1785）鄂什克安抚司改属懋功屯务厅。
乾隆五十一年（1786）绰斯甲布安抚司改属懋功屯务厅。
民国三年（1914），将懋功屯务厅改设懋功县。
民国二十四至民国二十五年（1935-1936），
中国工农红军长征时于县域内建立了苏维埃政权。
1950年9月19日，懋功解放，于10月10日建立懋功县人民政府。
1952年1月成立懋功县联合政府。
1953年经政务院批准改懋功县为小金县。
所辖地区
本辖：
懋功屯：附郭。初名美诺屯，乾隆四十八年（1783）更名。
抚边屯：初名底木达屯，乾隆四十四年（1779）更名，裁大板昭屯入。
章谷屯：
崇化屯：
绥靖屯：乾隆四十四年（1779）省阿尔古厅入，原辖阿尔古、马尔邦、噶拉依三屯改置绥靖、崇化二屯。
鄂什克安抚司：乾隆二十年（1755）置沃日安抚司，属打箭炉厅；二十九年（1764）更名，五十年（1785）改属直隶厅。
绰斯甲布安抚司：康熙四十一年（1702）置，属打箭炉厅；乾隆五十一年（1786）改属直隶厅。
阿尔古直隶厅：康熙六年（1667）大金川归附；雍正元年（1723）置大金川安抚司，属松茂道；乾隆四十一年（1776）改置直隶厅；四十四年（1779）并入美诺直隶厅。
地名释义
清朝乾隆帝大小金川之役平息后，置直隶厅，治所设于小金川土司衙署故地美诺得名美诺直隶厅。“美诺”为藏语，意为底下地方之意。
乾隆四十八年（1783年）改美诺直隶厅为懋功屯务厅。“懋”与“茂”通，盛大之意，“功”即功劳、功绩，“懋功”即盛大功劳、功绩之意。自诩“十全老人”的乾隆帝以
大小金川之役为其“十全武功”中的两大武功，为“永杜后患，不必复存大小金川之名”而标榜其盛大武功、盛大功绩，将美诺厅更名为懋功厅，蕴含征服、歧视两金川被征服者的用意。
典故出处
《宋书·武帝纪中》：“自篇籍所载，生民以来，勋德懋功，未有若此之盛者也。”
《隋书·高劢传》：“闻夷凶翦暴，王者之懋功，
取乱侮亡，往贤之雅诰。”
明陆采《怀香记·受诏安边》：“须紧把
乌号控，万里干城奏懋功。”
姚雪垠《李自成》第三卷第二八章：“卿受命援锦 ，躬亲戎行；未建懋功，遽成国殇。呜呼痛哉！”