戈尔诺-巴达赫尚自治州（塔吉克语： Вилояти Мухтори Кӯҳистони Бадахшон/Viloyati Mukhtori Kuhistoni Badakhshon/ولایت مختار کوهستان بدخشان；俄文：Горно-Бадахшанская (автономная область) / Gorno-Badakhshanskaya (a.o.)）是塔吉克斯坦的一个多山地的自治州。名称源于俄语，意思是“多山地的巴达赫尚”。

戈尔诺-巴达赫尚自治州境内大部分地区属于帕米尔高原，中国古代称“葱岭”，是自汉武帝以来开辟的丝绸之路之必经之地。

1890年以前，此地居民臣服于满清政府，划归新疆省管辖。19世纪后期，英、俄在亚洲争夺势力范围，因此1890年沙皇俄国进驻并控制了包括此地在内的帕米尔高原北部地区。从清朝到中华民国，中国政府始终坚持对此地拥有主权，不承认沙俄和苏联的占领合法，但是却无力对此地实行有效控制。

戈尔诺-巴达赫尚自治州成立于1925年1月2日，苏联时代被划成戈尔诺—巴达赫尚自治区（Горно-Бадахшанская автономная область）。1929年，塔吉克苏维埃社会主义共和国成立后，该区成为共和国的一部分。1950年代，戈尔诺—巴达赫尚自治区的大量土著居民帕米尔人被迫迁往塔吉克西南部。1991年，塔吉克斯坦独立后，该区改名为“戈尔诺－巴达赫尚自治州”。1992年，塔吉克斯坦爆发内战时，自治州政府宣布独立。在内战期间，许多帕米尔人被其他族群杀害，该州也是反对派的大本营。后来自治州政府放弃了独立要求。

中华人民共和国和塔吉克斯坦共和国分别于1999年和2002年签署了《中塔国界协定》和《中塔国界补充协定》。 2000年7月，中塔吉三国又签署了《中塔吉关于三国国界交界点的协定》，为彻底解决中塔两国边界问题奠定了基础。2002年5月，塔吉克斯坦总统埃莫马利·拉赫蒙访问中国，同意把靠近帕米尔地区存在争议的28,000平方公里土地中的3.5%共大约1,000平方公里的领土交给中国，从而结束了边界争议。

戈尔诺-巴达赫尚自治州有7个区、1个市、42个村。州行政中心是霍罗格（Хорӯғ），也是该州最大城市，人口22,000（2002年统计）；第二大城市为末合（Мурғоб），人口约 4,000（2002年统计）。

戈尔诺-巴达赫尚自治州的七个区分别是：万奇县（Ванҷ / ونج）、达尔瓦玆县（Дарвоз / درواز）、伊斯卡希姆县（Ишкошим / اشکاشم）、穆尔加布县（ Мурғоб / مرغاب）、罗什特卡拉县（Роштқалъа / راشت قلعه）、鲁珊县（Рӯшон / روشان）、赛格南县（Шуғнон / شغنان）。

戈尔诺-巴达赫尚自治州位于塔吉克斯坦共和国东部。北部与吉尔吉斯斯坦接壤，西部和南部与阿富汗相邻，东部与中国毗连。戈尔诺-巴达赫尚自治州面积6.37万平方公里，占塔吉克斯坦领土的44.5%。

戈尔诺-巴达赫尚自治州西部地区气候属于温带大陆性气候，年降水量为240毫米。东部地区是寒带气候，降水量很少。冬长夏短，冬季寒冷，夏日凉爽，年降水量为60---70毫米。

戈尔诺-巴达赫尚自治州位于帕米尔高原，是世界上平均海拔仅次于西藏高原的高原地区。州内自然条件不一，东西差别悬殊。西部地区凹凸不平，山脉交错。万奇山脉（海拔5584米，长约肋公里，多冰川，总面积221．1平方公里）、亚兹古列姆山脉（海拔6974米，有冰川，总面积约770平方公里）、鲁尚山脉（长约120公里，海拔6080米，位于贡特河与巴尔坦格河之间，有冰川）、舒格南山脉（长约80公里，海拔5704米，有冰川分布，总面积150平方公里）由东北向西南连绵起伏；科学院山脉（高7495米）、伊什卡希姆山脉（位于帕米尔的西南部，沿喷赤河右岸分布，海拔6096米）横亘南北。许多谷地海拔2000--3000米。戈尔诺-巴达赫尚自治州的东部是辽阔的高山草原地带，北起外阿莱山脉的南坡，南迄喷赤河岸。

帕米尔高原的最高处，以及苏联时期中亚五座海拔7,000米以上的山峰其中三座都位于本州：独立峰（前称列宁峰，海拔7,134米，在吉尔吉斯斯坦边界上），伊斯梅尔·萨马尼峰（前称共产主义峰，海拔 7,495米）和Korzhenievski峰（海拔 7,105米）。

戈尔诺—巴达赫尚自治州矿产资源丰富，是锡、锌、铅、钨、钼以及盐、石棉、煤、宝石、碧玉、水晶、滑石、各种大理石、花岗石的产地。

戈尔诺-巴达赫尚自治州共有居民约20万（2002年统计），占塔吉克斯坦共和国总人口的3.3%。其中主要民族为塔吉克族，少数为柯尔克孜族和俄罗斯族。

戈尔诺-巴达赫尚自治州是多种帕米尔语的故乡，其中万奇语（Ванҷ）已在19世纪灭绝。除此之外，俄语和塔吉克语都在当地通用，而末合地区有不少操吉尔吉斯语的居民。当地主要宗教为伊斯玛义什叶派伊斯兰教，对阿迦汗的崇拜十分流行。

农业是戈尔诺-巴达赫尚自治州的主要经济部门。农业依靠灌溉，主要集中在西帕米尔，种植谷物、蔬菜、瓜类作物和马铃薯。有园艺业和养蚕业。东帕米尔以畜牧业为主（主要有大尾羊和牦牛）。地方工业正在发展。轻工业、食品工业和建材工业等是自治州工业的主要部门。建有霍罗格、卡来胡姆、万奇、克苏斯水电站。

戈尔诺-巴达赫尚自治州对外联系有四条路线，分别是霍罗格—奥什、霍罗格—杜尚别 （前两者路况较佳，属帕米尔公路一部份）、霍罗格—塔什库尔干 （中经库里玛口岸）和霍罗格—瓦罕走廊—阿富汗边界。另外霍罗格和杜尚别之间有航线。

戈尔诺-巴达赫尚自治州有普通教育学校数百所、音乐学校、职业技术学校、医务学校各1所。科研机构有塔吉克斯坦共和国科学院帕米尔生物研究所。文化设施有剧院、群众图书馆、博物馆、人民创作之家、俱乐部、电影放映站等。

2005年06月24日，戈尔诺-巴达赫尚州与中国喀什地区结为友好城市。