1911年8月中国红十字会扬州分会建立。1956年，地辖扬州市红十字会成立。1983年扬州体制改革建立省辖市，1984年5月3日经
扬州市人民政府批准，成立省辖扬州市红十字会。在政府和上级红十字会的的重视、指导、支持和资助下，扬州市红十字会事业得到了迅速发展，在依法建会、红十字运动知识普及、国际人道法传播、救灾救助、卫生救护培训、无偿献血、红十字青少年工作、捐献造血干细胞及遗体捐献等方面取得了显著成绩，树立了人道主义社会救助团体的良好形象，成为社会发展的重要组成部分，为构建和谐社会作出了积极的贡献。
1933年扬州分会改为江都县分会。1937年12月14日扬州被日军侵占后江都县分会工作被迫停顿。
抗日战争胜利后，总会于1945年11月21日发布通告“整顿分会，以振会务”。1946年江都县分会进行分会复员筹备工作。王玉光、杨佳如等于1946年10月25日在南柳巷45号召开筹备会议，成立筹备处。同年12月1日召开会员代表大会暨分会医院开幕典礼，选举杨佳如为会长，朱干臣、蒋仁宇为副会长，王玉光为总干事，理事21人。扬州分会、江都县分会时期不独立设办公室，主要工作由总干事负责。下设：总务组。分管文书、人事、事务、会计；业务组。分管医务、社会服务。
1956年，在
江苏省红十字会的指导下，经
扬州市人民政府批准，扬州市红十字会正式恢复建立，组建第一届理事会。1962年，扬州市红十字会组建第二届理事会。
文化大革命期间，扬州市红十字会工作全部停顿。1982年12月13日经扬州市人民政府批准，（扬府发[1982] 307号），恢复扬州市红十字会工作，重新组建理事会。
1984年5月3日经扬州市人民政府批准，省辖扬州市红十字会正式成立，组建扬州市红十字会第三届理事会。1988年9月18日扬州市红十字会组建第四届理事会。同时在组织建设工作过程中，为贯彻
江苏省红十字会关于“对县市优先恢复或建立红十字会”指示精神，结合扬州市实际情况，报请扬州市人民政府批准，对县（市、区）红十字会进行恢复和组建。宝应于1991年、高邮于1990年、江都于1988年、仪征于1990年、广陵于1996年、郊区（维扬）于1992年、邗江于1988年分别组建了红十字会。1996年1月5日扬州市红十字会组建第五届理事会。2004年11月9日组建第六届理事会。2018年7月19日，中共扬州市红十字会党组召开专题学习会，市红十字会党组书记、常务副会长张宝马主持会议，市红十字会党组成员郑福源、潘杨参加。
全市共有基层组织236个，其中企业1个，事业单位66个，乡镇24个，街道2个，中学77个，小学66个；成人会员10485人，青少年会员84157人（其中大学410人，中学44495人，小学39252人），团体会员单位113个。