北京中医药大学附属护国寺中医医院位于北京市西城区棉花胡同83号，占地面积5637平方米，建筑面积13603平方米，是一所以中医中药治疗为工作主体，全面承担着医疗、教学、科研、预防、社区保健和康复任务的三级甲等针灸医院。

六十年代，作为北京中医学院（现北京中医药大学）的教学、实习医院。

1994年正式成为北京中医药大学附属医院。

1996年被评为全国示范中医医院。

1999年通过国家教学基地验收，同年被评为全国卫生系统先进单位。

2002年通过国家ISO质量认证中心“ISO 9001:2000”质量管理的考核验收。

2005年，在西城区政府的指导下，以传统的中医中药诊疗为主的护国寺中医医院和以“女儿式服务”著称的厂桥医院强强联合，实现资源的成功整合。

2007年被批准为“北京市针灸医院”。

2008年6月，骨伤科“宫廷正骨”录入了国家非物质文化遗产名录。

2012年医院通过了国家中医药管理局“三级专科医院”的评审验收。

2019年11月12日，北京中医药大学附属护国寺中医医院（项目：中医传统制剂方法（安宫牛黄丸制作技艺））入选国家级非物质文化遗产代表性项目保护单位名单。

党委书记：周京武

优势专科建设：骨伤科、针灸科。

医院开设内科、外科、针灸科、肿瘤科、骨科8个病区，门诊设有内科、外科、针灸科、骨科、妇科、儿科、皮肤科、眼科、五官科、口腔科、急诊科、放射科、检验科、心电、超声科、心脑功能捡查科、手术室、中西药房、中西药制剂等科室30余个。其中，拥有国家级重点专科2个（针灸科及骨伤科），北京市市级诊疗中心3个（中医特色针灸诊疗中心、中医特色骨伤诊疗中心、中医特色肿瘤诊疗中心）。

医院开放床位365张，配备吸附式三维立体动态干扰电治疗仪、德国菲兹曼双频超声治疗仪、日本伊藤磁振热治疗仪、法国施乐辉肩关节被动运动仪、日本尼虹SSP神经智能治疗仪及微波治疗仪、台湾汉唐激光治疗仪、湿热敷治疗装置、脑电仿生电刺激仪、低周波治疗仪等仪器设备。

2022年4月，北京中医药大学附属护国寺中医医院团委被表彰为“北京市五四红旗团委”。

北京市西城区棉花胡同83号。