接种室又称无菌室，是分离和移接菌种的小房间，实际上是扩大的接种箱。

在构造和设置上要求如下：

① 接种室应分里外两间，里面为接种间，面积5~6m2；外间为缓冲间，约2~3m2。两间门不宜对开，出入口要求装上推拉门。高度均为2~2.5m。接种室不宜过大，不易保持无菌状态。②房间里的地板、墙壁、天花板要平整、光滑，以便擦洗消毒。③门窗要紧密，关闭后与外界空气隔绝。④房间最好设有工作台，以便放置酒精灯、常用接种工具。⑤工作台上方和缓冲间天花板上安装能任意升降的紫外线杀菌灯和日光灯。

因接种室面积大，所以紫外线消毒的时间需30min左右。为提高接种成功率，进入接种室要穿戴经过消毒的衣、帽。菌种制作大多采用接种箱操作。