沉积构造环境所含
生物化石以具硅质骨骼的浮游型放射虫为主，有时也可见
牙形石、
海绵骨针等共生，一般代表海洋深部碳酸盐溶解面（CCD面）以下的深水环境。在欧洲阿尔卑斯山区，放射虫硅质岩出现于晚侏罗世，代表陆壳开裂至洋盆出现阶段的特点。从全球造山带地质特征看，放射虫硅质岩常与蛇绿岩套有关的洋脊、洋岛火山岩共生，代表已消失古海洋的重要地质记录。在中国不少造山带发现放射虫硅质岩，20世纪90年代在江西省弋阳县樟树墩至德兴市一带的原定为中元古代双桥山群与南华纪志棠组中，发现4处晚古生代放射虫硅质岩，有其特殊构造意义。
应当指出，放射虫硅质岩可以出现在大洋盆地、洋岛海山、弧后盆地甚至靠近大陆边缘的海域，可以通过硅质岩的地层组合序列（长期洋盆组合或短暂深水层位）、岩性组合（有无陆源碎屑混入）、化石群生态组合（不同放射虫类群和海绵骨针含量）和
稀土元素特征（是否存在铈负异常）等方面予以鉴别。